Rapporti medici e storici indicano che tra 50 e 100 milioni di persone morirono in tutto il mondo durante la pandemia di influenza A (H1N1) del 1918. La malattia fu riconosciuta per la prima volta nell’estate del 1918 in diversi continenti, raggiunse il picco nell’autunno del 1918 e persistette fino al inverno del 1919. Una mortalità eccezionalmente alta è stata segnalata in individui sani di età compresa tra 20 e 40 anni, insieme a gravi malattie negli anziani e nei bambini piccoli.

sfondo

Nonostante la speculazione nel 1918 che il virus avesse causato l’epidemia, fu confermata negli anni ’30. Gli studi degli anni ’90 hanno rivelato che l’agente eziologico della pandemia del 1918 era il virus dell’influenza A (IAV) del sottotipo H1N1. Da allora sono stati ricostruiti due genomi IAV completi di vittime morte nel settembre 1918 a Camp Upton, New York (CU) e nel novembre 1918 a Brevig Mission, Alaska (BM). Inoltre, una sequenza completa e 15 parziali del gene dell’emoagglutinina (HA) sono state ottenute da pazienti che hanno ceduto alla malattia tra maggio 1918 e febbraio 1919 negli Stati Uniti e nel Regno Unito.

Gli studi hanno suggerito che almeno sette segmenti della diversità dei ceppi IAV che circolavano nella vasca dell’uccello sono stati ottenuti e trasferiti ai virus dell’influenza stagionale H1N1. Le ricostruzioni del virus del 1918 hanno indicato che il complesso HA e i geni della polimerasi erano i principali determinanti della patogenicità del virus. Tuttavia, molte domande relative alla pandemia del 1918 rimangono senza risposta.

Un nuovo studio è stato pubblicato in Comunicazioni sulla natura Sono stati effettuati recenti progressi nel recupero del DNA per sequenziare un genoma intero e due parziali del virus dell’influenza del 1918 da campioni prelevati a Berlino e Monaco.

sullo studio

Lo studio ha incluso una serie di 11 campioni polmonari fissati in formalina ottenuti dal Museo di storia medica della carità di Berlino e due ottenuti dal Museo di storia naturale di Vienna, in Austria. Successivamente, l’RNA è stato estratto da diverse regioni del polmone, seguito dalla preparazione della libreria, dal sequenziamento e dall’analisi dei dati NGS. Infine, sono state eseguite analisi filogenetiche, di simulazione e funzionali.

Risultati

I risultati hanno determinato che le letture IAV in 3 su 13 campioni risalenti al 1918 erano associate ai risultati istopatologici di broncopolmonite. È stato riportato un genoma completo di IAV, MU-162 (Monaco di Baviera), e due genomi parziali, BE-572 e BE-576 (Berlino). Nei campioni sono stati identificati diversi batteri precedentemente associati a malattie respiratorie.

I campioni parziali di Berlino differivano al massimo di due siti in HA. Inoltre, il confronto del genoma BE-572 quasi completato con MU-162 ha identificato 22 SNP. In generale, la presenza di variazioni genetiche è stata rilevata nei genomi campionati in diversi continenti e in diversi periodi. Inoltre, è stata osservata un’attività due volte maggiore di BM rispetto alla polimerasi MU-162. Questa differenza di attività era principalmente dovuta a cinque mutazioni tra le subunità PA(3), PB1(1) e PB2(1) che riducevano l’attività della polimerasi rispetto a BM.

I risultati indicano che il virus si diffonde prevalentemente per trasmissione locale con una diffusione frequente su lunghe distanze. Inoltre, la presenza del residuo di amminoacido G222 nel dominio di legame del recettore del sottotipo di proteina H1 HA è stata associata a una maggiore gravità del virus tra il periodo pre-pandemico e il periodo di picco. Sono stati osservati altri due cambiamenti di aminoacidi tra i picchi pre-pandemici, sono stati osservati residui di tipo aviario in posizione 16 (G) e 283 (L) della nucleoproteina per i ceppi pre-picco, mentre D16 e p283 sono stati osservati nel picco tensioni.

Inoltre, è stato riscontrato che sette segmenti stagionali di H1N1 hanno avuto origine negli uccelli, mentre uno di questi proveniva da un IAV H1 omozigote. Inoltre, è stato riscontrato che i virus pandemici umani stagionali H1N1 e 1918 con tutti i segmenti genici endogeni del ceppo stagionale umano si trovano all’interno della diversità dell’influenza pandemica.

Conclusione

Pertanto, il presente studio indica un’origine puramente epidemiologica dei virus H1N1 stagionali. Tuttavia, sono necessarie ulteriori ricerche per garantire i risultati di questo studio sullo scenario alternativo della riclassificazione omosessuale.

Lo studio presenta alcuni limiti. In primo luogo, la dimensione del campione di studio è molto piccola. In secondo luogo, i campioni patologici sono rari e difficili da localizzare.